主菜单 (移动)-块

主菜单块

Saalfeld 实验室

Janelia7_blocks-janelia7_secondary_menu | 块
更多信息在此实验室登陆页面
Custom_misc-custom_misc_lab_updates | 块

实验室更新

18 07/25 | 了解约翰波哥大新的果蝇大脑和腹侧神经索的无偏模板。所有资源都可用这里
节点: field_content_header | entity_field
当前研究
点: field_content_summary | entity_field

神经连通性的尺度重建

节点: 主体 | 实体 _ 字段

中央大脑黑腹果蝇由 10 万个神经元组成,装进大约 500 × 400 × 200 μ m 的盒子里3。单个神经元可以跨越几个 μ m 的距离,然而,它们的单个投影直径可以薄至 40 纳米。今天,只有电子显微镜 (EM) 提供了空间分辨率、视野的充分组合, 和吞吐量对这种大小的生物神经系统进行整体成像,并有可能重建完整的接线图。在 Janelia,我们使用两种互补的 EM 成像技术,(1) 串行块面扫描结合离子束铣削 (FIB-SEM,Hess 实验室,FlyEM 项目团队) 产生各向同性图像数据的分辨率通常为 8 纳米3每体素,和 (2) 串行部分传输成像 (ssTEM,Bock束缚实验室) 生成典型的 4 × 40 纳米的非各向同性图像数据3每个体素。在该决议中,a果蝇大脑可以容纳 40- 80万亿个体素。

电子显微镜 (EM) 图像的连通性分析需要高效的自动化和手动校对。当前最先进的自动图像分析方法对数据质量有很高的要求,以便在合理的时间内提供令人满意的结果。然而,FIB-SEM 和 ssTEM 都有自己的一套准备和成像伪影,这使得自动和手动重建成为一项不平凡的工作。我们正在开发新的自动方法和用户界面来补偿这些伪影,并从受损的数据和互补的成像模式中实现高质量的自动连接重建。为了应对项目的规模,我们非常重视软件设计,注重效率、可扩展性和可重用性。